临床症状急性病例表现发育不良、衰弱、菱顿、食欲下降、拉淡灰色或淡绿色稀便。典型症状可见一侧或双侧眼结膜发炎：眼睑增厚，流出大量清水样分泌物，以后则变为脓性分泌物。重者可致眼球萎缩以至于失明。鼻腔也发生浆液性或脓性炎症，病情严重的可见肺炎及气囊炎引起的呼吸困难，此时可听见鸽发出吱嘎或格格声，病鸽变得衰竭、瘦弱。
存活者恢复而变为带菌者。其他一些鸽也可经过感染而进人带菌期，不显症状或发生短暂的腹泻。如果这些带菌者存在于环境性逆境或者继发感染了沙门氏菌病或滴虫病，即发生急性病的病变和症状，以致死亡。
剖检病变：在没有并发或继发症的病例，可见气囊增厚，腹腔浆膜面和肠系膜上附有纤维蛋白性渗出物，有的在心外膜上也见有这样的渗出物。肝常见肿胀、柔软和变色。脾充血肿大、柔软、色变深。胃肠道充血、出血，发生卡他性肠炎时，则可见在泄殖腔内容物中含有大量的尿酸盐。隐性感染的老龄鸽如复发时，可见肝大，严重充血，实质弥散有针头状坏死灶，脾脏异常肿大，被膜破裂内出血。这种病例临床可见突然死亡。
防治衣原体病的诊断不能单凭“典型”的肉眼变化、细胞变化或临床症状立即作出肯定诊断。而必须从宿主病变组织中分离和鉴定出衣原体。病原分离可无菌采集出现衣原体症状和病变的组织及分泌物，如气囊、牌、心包、心肌、肝和肾。
活禽可采集粪便、泄殖腔棉拭子、血液(加肝素抗凝血，在发热期采)、结膜分泌物和腹水(如果有呼吸困难时)，作衣原体分离检查。组织和湿标本或干燥分泌物的触片在适当处理后，在光镜下(≥)直接检查，最好用相差显微镜观察，若见到多量球状体，直径0.2-0.4微米，特别是在大多数单核细胞内出现，表明为衣原体感染。
鉴别诊断要注意与巴氏杆菌病、大肠杆菌病相区别。有研究表明，很难有效地治疗鸽的慢性衣原体感染和消灭带菌状态。在急性流行期，口服有效抗菌素(抗生素)可以极为明显地降低幼鸽死亡率，但此法不能完全地阻止感染，以致产生可感染他鸽的带菌者。而若将治疗期和不治疗期交替实施，可最终消灭带菌状态。
治疗可采用四环素、氧霉素和红霉素，每日每只口服0.05-0.08克，分2次喂，连用5-7天。预防量减半。也可采用金霉素和土霉素，用金霉素拌料，可按0.04%~0.06%拌料，口服剂量按2.5万单位/次，日服2次。
鸽群中发现本病后，数量少可考虑淘汰，数量大的应严格隔离治疗，严禁运出尸体，下脚料及病鸽群中的肉鸽。鸽舍和用具须用有效消毒药消毒，被污染的饲料销毁，卵也应消毒。工作人员在处理病鸽及鸽舍时，应注意个人防护，防止人员感染。
平时的预防管理措施，从原则上讲，应该让鸽饲养在不与任何潜在污染的器具或房舍接触的隔离舍内，也要防止与潜在的贮存宿主或像野禽这样的媒介接触。具体措施包括：经常保持环境卫生，定期消毒；限制人员流动范围，不让参观者随意进人鸽舍。
因为衣原体的传播主要是由于吸入了来自病禽的干燥粪便，所以应该将新孵出的无衣原体感染的鸽子放在没有来自感染禽的粪便、垫草、羽毛、分泌物及尘埃的环境中。引进新鸽时，应作血清学检查，反应阴性者方可人群。
值得注意的是人可经过呼吸道，与病鸽及其产品接触，或经伤口感染鸟疫。人感染此病后，全身虚弱、体温升高、头痛、背痛、食欲下降、恶心、呕吐、出汗、流鼻血、咳嗽，并出现肺炎，重症者可引起死亡。治疗可用金霉素、四环素和红霉素。